Um gefährdete Vögel wie Flussuferläufer und Flussregenpfeifer zu schützen, werden an der Isar zur Brutzeit Schutzzonen eingerichtet.
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Auch Hunde müssten unbedingt aus den gesperrten Zonen herausgehalten werden. Zurückgelassener Müll stelle ebenfalls eine große Gefahr dar, locke er doch nachts Füchse auf die Kiesbänke, die auf Futtersuche auch ein Vogelküken nicht verschmähten. Und wohl auch an Eiern nicht vorbeigehen, die etwa der Flussregenpfeifer auf unbewachsenen Kiesinseln oder Kiesbänken in eine Nistmulde legt.
Mit dem Ausbau und der Begradigung der Flüsse sowie dem Bau von Kraftwerken habe sich das Bild aber dramatisch verändert. Die auf offene Flussauen spezialisierten Arten hätten dadurch große Teile ihrer angestammten Lebensräume verloren.
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